研究發現，越早施打子宮頸癌疫苗，所產生的抗體濃度就越高。與15至25歲女性相較，10至14歲少女的HPV抗體濃度至少高兩倍以上，台大醫院婦產部主治醫師鄭文芳建議，最好在還沒有性行為之前施打疫苗，保護效果最好。
國內約有六、七萬人次接種過子宮頸癌疫苗，目前兩大國際知名藥廠的疫苗陸續在台上市，搶奪自費疫苗市場，競爭也日趨白熱化，嗅得到相互較勁的火藥味，似乎連醫師也得選邊站。
主打「長效型」子宮頸癌疫苗「保蓓」聲稱，截至目前為止，已追蹤至第6.4年，保護效力仍達百分之百，預計在2010年會有完整9.5年的數據資料。
台大婦產部主治醫師鄭文芳表示，不少家長質疑子宮頸癌疫苗保護力的年限，不過，國內外臨床研究預估，接種「保蓓」後，預防效果至少長達15至20年。
另一家先進入台灣市場的子宮頸癌疫苗「嘉喜」也不甘示弱，強調自家疫苗抗體與人類乳突病毒的相似度最高，以18 為例，只要少量抗體及佐劑，就能達到最佳的預防效果。
嘉義長庚醫院婦產科主任曾志仁指出，全球已有四千多萬人接種過「嘉喜」，迄今沒有失敗的個案，證明此疫苗具有非常好的記憶能力，一旦遭受人類乳突病毒感染，就會喚醒記憶，產生保護力。
事實上，在台灣上市的兩種子宮頸癌疫苗對於人類乳突病毒第16及18型所引起的子宮頸癌癌前病變，都具有百分之百的防護效力，價格也差不多，確實讓民眾很難決定。
究竟是「保蓓」好，還是「嘉喜」強，醫師們各有不同看法，但在子宮頸癌防治上的提醒，卻相當一致。醫師都建議，越早施打越好，如果已有性行為，在施打疫苗之前，最好先接受抹片檢查；接種之後，仍應每年做抹片。