一般而言，有許多自體免疫疾病與免疫性流產有很大的關係，比如說抗磷酸脂質抗體症候群（antiphospholipid antibody syndrome）、紅斑性狼瘡、血栓性血小板低下紫斑症(thrombotic thrombocytopenic purpura, TTP)…等等。由於自身免疫系統的問題，很容易形成血栓、堵塞胎盤的血管，無法供給胎兒養份；或是造成胎盤本身發炎，產生抗體排斥胚胎，造成流產。
antiphospholipid antibody syndrome要驗其IgG(1200元)及B2-lipoprotein IgG(800元)
TTP...先驗CBC，看血小板數目，有少，再做PROTHROMIN TIME
SLE驗ANA(400元)